Aline Marguet

Chargée de recherche, équipe IBIS, Inria Grenoble Rhône-Alpes

Je m'intéresse à la modélisation de population de cellules pour l’étude des mécanismes associés comme la division cellulaire ou l'expression génique.

Mots clés : Processus structurés branchants, échantillonnage et individu typique, estimation du taux de division, modèles à effets-mixtes, algorithme SAEM, héritabilité.

J'ai effectué mon doctorat au Centre de Mathématiques Appliquées à l’École Polytechnique (CMAP) sous la direction de Vincent Bansaye et Marc Hoffmann.

Vous trouverez ici mon manuscrit de thèse et ici les transparents de la soutenance.

Publications

• Identification of stochastic gene expression models over lineage trees, avec E. Cinquemani, Proceedings of the 19th IFAC symposium on System Identification, Padova, July 13-16, 2021.

• Parasite infection in a cell population with deaths, avec C. Smadi, soumis, arXiv:2010.16070, 2020.

• Long time behaviour of continuous-state nonlinear branching processes with catastrophes, avec C. Smadi, à paraître dans Electronic Journal of Probability, arXiv:1908.11592, 2020.

• A non-conservative Harris’ ergodic theorem, avec V. Bansaye, B. Cloez, P. Gabriel, soumis, arXiv:1903.03946, 2019.

• Inheritance and variability of kinetic gene expression parameters in microbial cells: Modelling and inference from lineage tree data, A. Marguet, M. Lavielle, E. Cinquemani, Bioinformatics, 35(14), i586–i595, 2019. Suppl. Material.

• Statistical estimation in a randomly structured population, avec M. Hoffmann, Stochastic Processes and their Applications, 129, 12, 5236-5277, 2019.

• A law of large numbers for branching Markov processes by the ergodicity of ancestral lineages, ESAIM: Probability and Statistics, 23, 638–661, 2019.

• Uniform sampling in a structured branching population, Bernoulli, 25, 4A, 2649-2695, 2019.

• Probabilistic and Piecewise Deterministic models in Biology, avec B. Cloez, R. Dessalles, A. Genadot, F. Malrieu, et R. Yvinec, ESAIM: Proceedings and Surveys, 60, 225-245, 2017.

Biohasard 2021 : Stochastic Models for Biology

On Thursdays and Fridays from May 20 to June 11, 2021, online.

Exposés à venir

• 25-27 août, Journées MAS 2021, en ligne.

Derniers Exposés

• 07/2021 19th IFAC symposium on System Identification, Padova

• 06/2021 Séminaire de Modélisation aléatoire du vivant, Paris

• 02/2021 Séminaire de Probabilités et Statistiques, Montpellier

• 08/2020 Bernoulli-IMS One World Symposium 2020, Exposé pré-enregistré

• 05/2020 Séminaire de Statistique d'AgroParisTech, Paris

• 02/2020 Séminaire du LMAC, Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne

• 01/2020 Séminaire de probabilités et statistique, Laboratoire Paul Painlevé, Lille

• 12/2019 Séminaire de probabilité, Institut Fourier, Grenoble

• 12/2019 Séminaire d'unité MaIAGE, Jouy-en-Josas

• 11/2019 Séminaire d’équipe DRACULA, Lyon

• 11/2019 Growth and division in mathematics and medicine, Londres

• 10/2019, Séminaire du Master Mathématiques pour les Sciences du Vivant, Palaiseau

• 10/2019, Journée INRIA-Bio, Lyon

• 08/2019 BioHasard 2019, Stochastic Models for Biology, Rennes

• 07/2019 ISMB/ECCB 2019, Bâle

• 05/2019 École de printemps de la chaire MMB, Aussois

Enseignements

• 2018-2021, Biostatistics, M2 PhEDC, Université Grenoble Alpes

2014-2017, Monitrice à l'Université Paris-Sud

• 2015-2017, TP de R, Ecologie et statistiques en L2 Biologie, Université Paris-Sud

• 2014-2017, TD pour le cours de Calculus en L1 MPI, Université Paris-Sud

• 2014-2015, Colles parcours Bio-concours, Université Paris-Sud

Divers

• 2013, Colles en licence 2, Université de Rennes 1