Aline Marguet

Chargée de recherche, équipe IBIS, Inria Grenoble Rhône-Alpes

Je m'intéresse à la modélisation de population de cellules pour l’étude des mécanismes associés comme la division cellulaire ou l'expression génique.

Mots clés : Processus structurés branchants, échantillonnage et individu typique, estimation du taux de division, modèles à effets-mixtes, algorithme SAEM, héritabilité.

J'ai effectué mon doctorat au Centre de Mathématiques Appliquées à l’École Polytechnique (CMAP) sous la direction de Vincent Bansaye et Marc Hoffmann.

Vous trouverez ici mon manuscrit de thèse et ici les transparents de la soutenance.

Publications

• Long time behaviour of a general class of branching Markov processes, avec C. Smadi, soumis, arXiv:1908.11592, 2019.

• A non-conservative Harris’ ergodic theorem, avec V. Bansaye, B. Cloez, P. Gabriel, soumis, arXiv:1903.03946, 2019.

• Inheritance and variability of kinetic gene expression parameters in microbial cells: Modelling and inference from lineage tree data, A. Marguet, M. Lavielle, E. Cinquemani, Bioinformatics, 35(14), i586–i595, 2019. Suppl. Material.

• Statistical estimation in a randomly structured population, avec M. Hoffmann, Stochastic Processes and their Applications, 129, 12, 5236-5277, 2019.

• A law of large numbers for branching Markov processes by the ergodicity of ancestral lineages, ESAIM: Probability and Statistics, 23, 638–661, 2019.

• Uniform sampling in a structured branching population, Bernoulli, 25, 4A, 2649-2695, 2019.

• Probabilistic and Piecewise Deterministic models in Biology, avec B. Cloez, R. Dessalles, A. Genadot, F. Malrieu, et R. Yvinec, ESAIM: Proceedings and Surveys, 60, 225-245, 2017.

Exposés à venir

• 28/11/2019 Séminaire d’équipe DRACULA, Lyon

• 02/12/2019 Séminaire d'unité MaIAGE, Jouy-en-Josas

Exposés

• 11/2019 Growth and division in mathematics and medicine, Londres

• 10/2019, Séminaire du Master Mathématiques pour les Sciences du Vivant, Palaiseau

• 10/2019, Journée INRIA-Bio, Lyon

• 08/2019 BioHasard 2019, Stochastic Models for Biology, Rennes

• 07/2019 ISMB/ECCB 2019, Bâle

• 05/2019 École de printemps de la chaire MMB, Aussois

• 10/2018 Séminaire Statistique, Probabilités, Optimisation et Contrôle, Dijon

• 08/2018 Journées MAS, Dijon

• 03/2018 Séminaire de Probabilités et Statistiques, Montpellier

• 03/2018 Séminaire de calcul stochastique, Strasbourg

• 03/2018 Séminaire de Probabilités, Toulouse

• 01/2018, Groupe de travail Math-Bio, Grenoble

• 09/2017, Journée de rentrée des doctorants de l’École doctorale de mathématiques Hadamard, IHES, Gif-sur-Yvette

• 09/2017, Session du GDR Mamovi, Lyon

• 09/2017, Séminaire de Probabilités de l'institut Fourier, Grenoble

• 11/2016, Paris-Berlin Young Researchers Workshop : Stochastic Analysis with applications in Biology and Finance, Berlin

• 08/2016, Journées MAS, Grenoble

• 06/2016, École de printemps de la chaire MMB, Aussois

• 04/2016, Colloques de Jeunes Probabilistes et Statisticiens, Les Houches

• 03/2016, Séminaires de doctorant-e-s de probabilités, Université de Rennes 1

• 01/2016, Groupe de travail des thésards du LPMA, Paris

• 11/2015, Forum des jeunes mathématicien-ne-s, Lille

• 10/2015, Séminaire des doctorant-e-s, CMAP Palaiseau

Enseignements

2014-2017, Monitrice à l'Université Paris-Sud

• 2015-2017, TP de R, Ecologie et statistiques en L2 Biologie, Université Paris-Sud

• 2014-2017, TD pour le cours de Calculus en L1 MPI, Université Paris-Sud

• 2014-2015, Colles parcours Bio-concours, Université Paris-Sud

Divers

• 2013, Colles en licence 2, Université de Rennes 1